В.Я. Науменко родился в крестьянской семье в селе Василевичи Василевичского района Полесской области (ныне г. Василевичи, Речицкий р-н, Гомельская обл.). После окончания Василевичской средней школы в 1952 году он поступил на геолого-географический факультет Белорусского государственного университета на отделение физической географии. Будучи студентом В.Я. Науменко активно включился в научно-исследовательскую работу по руководством А.Х. Шкляра и В.А. Дементьева. Они изучали фенологию яровых культур Беларуси, аномалии в распределении атмосферных осадков и гроз на земном шаре (работа была удостоена первой категории на республиканском конкурсе научных студенческих работ). Он принимал активное участие в студенческих научных конференциях в БГУ и за пределами Республики Беларусь. После окончания Белорусского государственного университета В.Я. Науменко был направлен на работу в Брестский государственный педагогический институт имени А.С. Пушкина и 1 сентября 1957 года начал преподавать на кафедре ботаники и географии. В 1960–1965 годах он работал деканом естественно-географического факультета. С 1966 по 1994 года Владимир Яковлевич был проректором по заочному обучению Брестского педагогического института. С мая 1994 г. В.Я. Науменко – проректор по учебной работе и социально-экономическим вопросам БГПИ (в дальнейшем Брестского государственного университета имени А.С. Пушкина).
В 1968 году В.Я. Науменко возглавил созданное Брестское отделение Географического общества Белорусской ССР, которое в 1969 году было преобразовано в Брестский отдел ГО БССР. В это время проводятся комплексные исследования Брестской области (природа, население, хозяйство, населенные пункты), результаты которых послужили основой для написания монографии «Брест. Историко-экономический очерк» (1970 и 1977 гг.). Исследования сельского хозяйства воплотились в кандидатскую диссертацию «Структурные и территориальные различия в сельском хозяйстве Брестской области». В.Я. Науменко - автор учебного пособия «Сельское хозяйство Белоруссии» для студентов географических факультетов вузов. В 1990 г. Государственным комитетом СССР по народному образованию В.Я. Науменко присвоено ученое звание профессора.

В декабре 1994 г. проректор профессор В.Я. Науменко избирается (по совместительству) заведующим кафедры географии Беларуси. На протяжении всего периода работы в Брестском пединституте и университете В.Я. Науменко много внимания уделял совершенствованию учебно-воспитательного процесса. При его непосредственном участии в Брестском лесничестве в районе оз. Белое была создана база для проведения полевых практик по географии и биологии. С созданием кафедры географии впервые в истории вуза стали проводится комплексные полевые практики в отдаленных от института территориях. Первые маршруты на Кавказ, Карпаты, в Карелию, на Байкал были разработаны В.Я. Науменко. Во время всех видов полевых практик студенты собирали минералы, горные породы, палеонтологические образцы, гербарий растений и др. Геологические коллекции полевых практик послужили основой для создания геологического кабинета. Основная коллекция минералов и горных пород была приобретена по его инициативе в московском магазине «Русские самоцветы». Все работы по созданию геологического кабинета проводились при непосредственном участии В.Я. Науменко.

Значительный вклад в развитие и совершенствование воспитательно-профессионального обучения внес В.Я. Науменко, являясь проректором по заочному обучению в течение 28 лет. Уделял огромное внимание профессиональному обучению студентов-заочников. Заведующими кафедрами были усовершенствованы учебные планы и программы, сопоставлены номенклатура и объем в часах дисциплин стационара и ОЗО, уточнены бюджет времени летней и зимней сессий, сроки вызова студентов на сессию. Количество экзаменов и зачетов было приведено в норму в соответствии с положением о курсовых экзаменах и зачетах и бюджетом времени. Были усовершенствованы графики учебного процесса по специальностям и курсам (разрешена сдача 1–2 экзаменов в межсессионный период, а также защита контрольных и курсовых работ, ликвидация академической задолженности). Совершенствовалась система прохождения педагогической практики с учетом профессионального состава студентов. Было издано пособие «Практика на заочных отделениях педагогических вузов (1981 г.). Кроме того, была разработана и издана контрольно-зачетная книжка студента-практиканта, в которой дирекцией школы отмечалась работа студента-заочника с 1 по 5 курсы. По проблемам заочного обучения В.Я. Науменко опубликовал ряд научных статей в сборниках «Методологические и методические аспекты исследования подготовки специалистов с высшим образованием» (1982 г.), «Актуальные проблемы высшего вечернего и заочного образования» (1983 г.) и др.

При непосредственном участии В.Я. Науменко была создана в институте лаборатория множительной аппаратуры. Лаборатория специализировалась на издании методических указаний, графиков учебного процесса для студентов-заочников и др.

В.Я. Науменко в своей педагогической деятельности много внимания уделял школьному географическому образованию. Систематически выступал перед учителями с лекциями в областном Институте усовершенствования учителей, являлся членом жюри областных и республиканских олимпиад школьников по географии. Им подготовлены и изданы многие пособия для учителей и учащихся. Его статьи вошли в «Хрестоматию по географии Белорусской ССР» (1977), «Хрестоматию по экономической географии БССР» (1991), энциклопедический справочник школьника «Геаграфія Беларусі» (1992).

Являясь председателем Брестского областного отдела педагогического общества он активно занимался изучением передового опыта и совершенствованием учебно-воспитательного процесса в школах, педагогических и профтехучилищах.

Учебная и научно-педагогическая деятельность В.Я. Науменко эффективно сочеталась с общественной работой. Он неоднократно избирался секретарем парторганизации административно-хозяйственных работников, членом и секретарем парткома пединститута, членом профкома, обкома отраслевого профсоюза. В 1972–1986 гг. являлся членом Белорусского республиканского комитета профсоюза работников просвещения, высшей школы и научных учреждений.

Результаты административно-организаторской, научной и научно-общественной деятельности В.Я. Науменко получили широкое признание. Он награжден медалью «За доблестный труд» (1970), значками «Отличник просвещения БССР» (1970), «Отличник просвещения СССР» (1979), «Отличник народного образования Республики Беларусь» (1999). В 1982 г. ему было присвоено почетное звание «Заслуженный работник высшей школы Белорусской ССР».

В.Я. Науменко был человеком широкой эрудиции и большого трудолюбия и является образцом для современного поколения преподавателей нашего университета.

Мешечко Е.Н. Жизненный путь и научная деятельность Владимира Яковлевича Науменко // Краеведение в учебно-воспитательном процессе школ и вузов: материалы III респ. науч.-метод. конф., посвящ. 80-летию со дня рожд. В.Я. Науменко, Брест, 16–17 февр. 2012 г. / Брестс. гос. ун-т; редкол.: Е.Н. Мешечко [и др.]. – Брест, 2012.